El CCT es una organización no gubernamental establecida en 1962 y declarada de interés público por el Poder Ejecutivo de la República de Costa Rica. El Centro Científico Tropical es la primera organización ambiental costarricense y celebra con orgullo su 50ª Aniversario en 2012. Desde 1972, el Centro Científico Tropical ha sido dueño y ha administrado la Reserva Biológica del Bosque Nuboso de Monteverde, una de las primeras reservas biológicas privadas de América Latina. La Reserva incluye más de 4,000 hectáreas de bosque de elevación intermedia en la Cordillera de Tilarán, y es considerada un modelo de gestión de área protegida en el ámbito global. Las prioridades principales de la Reserva son la conservación, la investigación, la educación ambiental, y el ecoturismo. El Centro Científico Tropical también ha sido pionero en los esfuerzos de conservación de la conectividad e iniciativas de corredores biológicos, tal como con el Corredor Biológico San Juan-La Selva, el cual se ha convertido en un referente en América Latina. El CCT también está activamente involucrado en la gestión del Corredor Biológico Pájaro Campana y del Corredor Biológico Alexander Skutch en Costa Rica, y forma parte del Comité Técnico de la Red Nacional de Corredores Biológicos de Costa Rica bajo el mandato del Programa Nacional de Corredores Biológicos.

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