Sekolah Menengah Kejuruan Malaka memiliki beberapa Jurusan atau Program Keahlian yang antara lain adalah sebagai berikut:
Teknik Mekanik Otomotif (TMO)
Teknik Pemesinan (TPM)
Teknik Pemanfaatan Tenaga Listrik (TPTL)
Teknik Komputer Jaringan (TKJ)
Multimedia (MM)